Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A2Q05940 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A2Q05940 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms