Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms