Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms