Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms