Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM3Q01628 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms