Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms