Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
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