Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms