Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIM1P81133 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIM1P81133 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIM1P81133 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIM1P81133 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIM1P81133 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIM1P81133 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIM1P81133 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms