Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms