Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms