Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTA2P62736 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms