Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX9P55771 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX9P55771 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX9P55771 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms