Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms