Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PGGT1BP53609 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PGGT1BP53609 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PGGT1BP53609 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PGGT1BP53609 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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PGGT1BP53609 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PGGT1BP53609 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PGGT1BP53609 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP53609 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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