Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA4P51532 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA4P51532 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms