Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RAB9AP51151 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RAB9AP51151 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RAB9AP51151 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RAB9AP51151 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RAB9AP51151 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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RAB9AP51151 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RAB9AP51151 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RAB9AP51151 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RAB9AP51151 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9AP51151 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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