Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSEN1P49768 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms