Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPFP49454 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPFP49454 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPFP49454 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPFP49454 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPFP49454 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPFP49454 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPFP49454 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPFP49454 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPFP49454 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPFP49454 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPFP49454 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPFP49454 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPFP49454 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPFP49454 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPFP49454 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPFP49454 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPFP49454 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPFP49454 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPFP49454 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms