Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms