Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDO2P48775 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDO2P48775 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDO2P48775 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDO2P48775 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDO2P48775 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDO2P48775 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDO2P48775 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDO2P48775 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDO2P48775 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDO2P48775 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TDO2P48775 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDO2P48775 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDO2P48775 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDO2P48775 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDO2P48775 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDO2P48775 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDO2P48775 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDO2P48775 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDO2P48775 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDO2P48775 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDO2P48775 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDO2P48775 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDO2P48775 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDO2P48775 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDO2P48775 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDO2P48775 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms