Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP5P45974 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP5P45974 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP5P45974 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP5P45974 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP5P45974 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP5P45974 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP5P45974 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP5P45974 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP5P45974 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms