Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGCXP38435 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGCXP38435 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GGCXP38435 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GGCXP38435 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GGCXP38435 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGCXP38435 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms