Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRCA1P38398 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA1P38398 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms