Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA7P36544 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms