Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC090568.2-206ENST00000521936 1469 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 PGM5P4-AS1-204ENST00000450636 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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HOXD11P31277 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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HOXD11P31277 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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HOXD11P31277 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC116348.1-201ENST00000562525 528 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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