Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms