Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID4AP29374 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms