Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2E2P29084 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms