Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSFA2P28290 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSFA2P28290 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms