Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms