Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PLNP26678 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PLNP26678 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PLNP26678 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PLNP26678 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PLNP26678 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PLNP26678 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PLNP26678 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PLNP26678 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PLNP26678 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PLNP26678 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PLNP26678 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PLNP26678 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PLNP26678 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PLNP26678 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PLNP26678 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PLNP26678 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PLNP26678 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms