Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB3BP20337 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms