Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGCP20142 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGCP20142 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGCP20142 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGCP20142 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGCP20142 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGCP20142 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGCP20142 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGCP20142 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGCP20142 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGCP20142 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGCP20142 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGCP20142 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGCP20142 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGCP20142 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGCP20142 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGCP20142 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGCP20142 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGCP20142 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGCP20142 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGCP20142 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGCP20142 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGCP20142 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGCP20142 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGCP20142 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGCP20142 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGCP20142 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms