Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD33P20138 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD33P20138 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD33P20138 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD33P20138 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD33P20138 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD33P20138 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD33P20138 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD33P20138 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD33P20138 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD33P20138 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD33P20138 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD33P20138 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD33P20138 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD33P20138 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD33P20138 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD33P20138 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD33P20138 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD33P20138 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD33P20138 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD33P20138 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD33P20138 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD33P20138 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD33P20138 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD33P20138 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD33P20138 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD33P20138 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms