Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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