Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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