Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms