Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD46P15529 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms