Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A1P13866 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms