Protein–RNA interactions for Protein: P13807

GYS1, Glycogen [starch] synthase, muscle, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS1P13807 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS1P13807 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS1P13807 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS1P13807 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS1P13807 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS1P13807 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS1P13807 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS1P13807 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS1P13807 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS1P13807 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS1P13807 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS1P13807 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS1P13807 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS1P13807 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS1P13807 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS1P13807 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS1P13807 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS1P13807 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS1P13807 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS1P13807 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS1P13807 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS1P13807 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS1P13807 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS1P13807 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS1P13807 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS1P13807 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS1P13807 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS1P13807 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS1P13807 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS1P13807 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS1P13807 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS1P13807 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS1P13807 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS1P13807 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS1P13807 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS1P13807 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms