Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms