Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms