Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DMDP11532 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DMDP11532 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DMDP11532 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DMDP11532 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DMDP11532 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DMDP11532 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DMDP11532 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DMDP11532 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DMDP11532 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DMDP11532 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DMDP11532 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DMDP11532 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DMDP11532 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DMDP11532 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DMDP11532 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DMDP11532 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DMDP11532 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DMDP11532 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DMDP11532 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DMDP11532 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DMDP11532 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DMDP11532 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DMDP11532 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DMDP11532 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DMDP11532 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DMDP11532 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DMDP11532 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DMDP11532 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DMDP11532 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DMDP11532 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DMDP11532 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DMDP11532 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DMDP11532 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DMDP11532 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DMDP11532 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DMDP11532 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DMDP11532 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DMDP11532 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DMDP11532 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DMDP11532 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DMDP11532 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DMDP11532 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DMDP11532 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DMDP11532 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DMDP11532 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DMDP11532 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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