Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms