Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms