Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms