Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRPRAP08240 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRPRAP08240 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRPRAP08240 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRPRAP08240 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms