Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms