Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HLA-DOAP06340 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DOAP06340 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms